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选取砧木首先应考虑与接穗要有较好的亲合力，保证嫁接苗生长正常即共生亲和力要好，其次要求砧木具有良好的适应能力，抗逆性强，抗病力强，能抗土传病害，耐低温，且嫁接后不影响接穗果实的品质，生产上一般用杂交白籽南瓜或哈密瓜，效果较理想。
甜瓜苗和葫芦苗属于不同的植物种类，所以它们之间不能进行嫁接。嫁接是指将两个植株的不同部位切割后通过愈合实现它们生长在一起，通常需要选取亲缘关系较近的品种进行嫁接。甜瓜和葫芦属于不同的植物科，植株形态、生长习性、果实性状等都存在明显的差异，因此无法进行嫁接。
如果想要进行瓜类植物的嫁接，可以选取同属于瓜科的其他品种，如黄瓜、西瓜等进行嫁接。
羊角蜜甜瓜一般采用南瓜做砧木进行嫁接育苗。嫁接时要注意砧木南瓜要提前羊角蜜甜瓜12~15天左右播种。而甜瓜一般在5天之后，2片子叶多完全伸展开之后就可进行嫁接。
播种前要进行温汤浸种（在55℃的水中浸泡10~15分钟，搅拌至30℃左右，搓洗种子表面附着的粘液，浸4~6小时左右，然后放在28~32℃的环境下催芽，等到70%左右的种子发芽之后就可以进行播种了）。
甜瓜嫁接可以用南瓜和冬瓜做粘木，但以南瓜为佳。
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